Análisis de datos metagenómicos (métodos en biología molecular, 2649)

Este volumen describe diferentes métodos de secuenciación, procesos y herramientas para el análisis de datos del metagenoma. Los capítulos guían a los lectores a través del control de calidad de los datos de secuencia sin procesar, bases de datos metagenómicas para anotaciones bacterianas como Greengenes, SILVA, RDP y GTDB, guía para el análisis del microbioma del ARNr 16S y canales como mothur, DADA2, QIIME2, canal de análisis de datos metagenómicos de escopeta del genoma completo utilizando MEGAN. y DIAMOND, servicio web como PATRIC, RDP, mothur, Kaiju, PhyloPythiaS, MG-RAST, WebMGA, MicrobiomeAnalyst, WHAM!, METAGENassist y MGnify: EBI-Metagenomics, MG-RAST Metagenomics Analysis. Luego, los capítulos informan a los lectores sobre los enfoques de secuenciación de tercera generación (TGS) como la secuenciación MinION y enseñan el uso de la configuración de la máquina virtual Ubuntu Linux, resistencias clínicas y ambientales, el uso de técnicas FISH y el diseño de sondas FISH, protocolos para metagenómica viral y pautas completas. para el análisis de microbiomas utilizando los paquetes R más utilizados. Escrito en el formato de la exitosa serie Métodos en biología molecular, cada capítulo incluye una introducción al tema, enumera los materiales y métodos necesarios, incluye consejos sobre resolución de problemas y errores conocidos, y protocolos paso a paso fácilmente reproducibles. Análisis de datos metagenómicos: métodos y protocolos, autorizado y de vanguardia, tiene como objetivo ser una guía completa para que los investigadores se especialicen en el campo de la metagenómica.

• | Autor: Suparna Mitra
• | Editorial: Humana
• | Fecha de publicación: 02 de junio de 2023
• | Número de páginas: 454 páginas
• | Idioma: inglés
• | Encuadernación: Tapa dura
• | ISBN-10: 1071630717
• | ISBN-13: 9781071630716